شجره مفاهیم آیات و سیاق پیدا شده، مفهوم محوری و مفاهیم فرعی؛ شامل و مشمول؛ رنگ معنای آیه یا سیاق و جایگذاری معانی و واژگان در طیف معنا(و رتبه بندی آنها در طیف) بر اساس شاخصه‌ها و یا موضوع محوری و هدف.
پیدا کردن واژه‌ها موثر و متاثر(اصلی و و ابسته)
کمک گرفتن از (رنگ مفاهیم و واژگان، مفهوم محوری و مفاهیم وابسته ا که دارای رنگ مشابه باشند) در مشابه یابی در فرازهای قرآن و یا کتب اشعار
ارتباط دهی مفاهیم در یک آیه، فراز یا سوره براساس رنگ‌بندی واژگان، رتبه بندی ها در طیف و مفهوم محوری و فرعی؛ شامل و مشمول بودن و ... و تشکیل شجره فاهیم آن آیه یا سیاق و سوره که دارای مفهوم محوری به عنوان ریشه آن درخت می‌باشد.
بر اساس شجره مفاهیم هم مقصود آیه درک می‌شود و هم مشاب یابی صورت می‌گیرد.
گروه‌بندی بر اساس لغت، صرف، نحو(لسان قرآن)
گروه بندی بر اساس لغت با توجه به متضادها، مترادفها یا معانی هاله‌ای و در نظر گرفتن این موضوع که ریشه ها با رفتن در (بابهای صرفی یا ظرفهای زمان و مکان و موضوع و یا یک فرد) از آنها رنگ گرفته و دچار تغییر معنایی میشوند و جهت و رنگ مفهومشان تغیر میکند.
گروه بندی بر اساس مفاهیم؛ بر اساس هم جوارها(بر اساس هم نشین ها ): در گروه بندی همنشین های یک واژه نیز دسته بندی های جهت داری صورت گیرد.
در قسمت مفاهیم: پیدا کردن معنای اصلی، پیدا کردن معنای هاله‌ای و فرعی، پیداکردن معنای تبعی، پیداکردن مصادیق و واژگان دارای معانی اصطلاحی
